Что значит топология белка?
Общие свойства объектов, не зависящие от формы конкретных экземпляров.
Ну наверное, имеется в виду, что белки различной топологии - это те, которые нельзя совместить непрерывной (т.е. без разрывов связей) деформацией в пространстве. Если знать, как выглядят молекулы белков в пространстве, то должно быть понятно, наверное (я не знаю 
).
Это я предполагаю; возможно, в химии имеется какое-то своё понятие топологии.
). Это я предполагаю; возможно, в химии имеется какое-то своё понятие топологии.
Насколько я понимаю, это абстракция формы от метрики.
Типа справа всегда справа, независимо от того, насколько.
Типа справа всегда справа, независимо от того, насколько.
А у листа бумаги всегда две стороны, независимо от того, Мебиуса он, или нет.
мб взаимное расположение частей чего-либо (например, субъединиц белка) в пространстве?
"Справа" - это не абстракция формы от метрики.
дилетанты любят говорить красиво
то, что они имели в виду, это чем кольцо отличается от палки. а типа Р и Ь - одно и то же
то, что они имели в виду, это чем кольцо отличается от палки. а типа Р и Ь - одно и то же
похоже ещё один синоним русского слова "ФОРМА"
т.е. получается, что топология не зависит от первичной структуры белка, а определяется его формой,
а нативная форма для каждого белка существует одна, а с другой стороны, любые разные белки не могут быть одинаковыми, т.е. все белки "топологически" разные?
что-то странно, не может такого быть
может имеется ввиду похожесть по форме разных белков, а не их точное соответствие?
последнее точно не возможно
а нативная форма для каждого белка существует одна, а с другой стороны, любые разные белки не могут быть одинаковыми, т.е. все белки "топологически" разные?
что-то странно, не может такого быть
может имеется ввиду похожесть по форме разных белков, а не их точное соответствие?
последнее точно не возможно
давай побольше контекста, а то действительно непонятно. Но пока я бы согласился с точкой зрения о том, что "любят говорить красиво". Иными словами, думаю, что имеется в виду форма конформации как сплошного геометрического объекта.
все, теперь немного ясно
под "топологиями" имели ввиду альфа-спирали (a-helix) и бета-листы (b-sheets) белков, т.е. белки сравнивали в таком структурном отношении
например, белки каждой названной структуры имеют различную топологию
под "топологиями" имели ввиду альфа-спирали (a-helix) и бета-листы (b-sheets) белков, т.е. белки сравнивали в таком структурном отношении
например, белки каждой названной структуры имеют различную топологию
пидарасы... я ни разу не видел, чтобы альфа-спирали и бета-листы называли топологиями. Есть же термин - вторичная структура.
пидарасы...+1
Поджигаете, ребята!Это из статьи. Скорее всего за границей принято так говорить, или, по крайней мере, в расчетной химии этот термин очень часто используется
Нифига оно не русское. В русском не было буквы "Ф"
объясните простым языком, плзОдно из напрвлений топологии - люди занимаются инвариантами узлов и зацеплений. Вводятся топологические инварианты, и потом можем узнать про 2 узла являбтся ли они топологически жквивалентными (как правило инварианты узлов - гомотопические инварианты)
в контексте, белки различной топологии (proteins of different topology)
Белки могут скручиваться и образовывать зацепления, вот и смотрят на тип зацепления.
Я прав?
а что за зацепления могут образовывать белки?
как физически себе это представить?
как физически себе это представить?
Да, белки, как и другие полимеры, могут образовывать зацепления (это, например, на упругость расплава полимеров влияет но ShOleg говорит, что тут имеется в виду не это, а вторичная структура. Так что это слово тут не стоит говорить.
В биологии под топологией понимают обычно не то, что в математике и когда говорят о топологии белка - имеют ввиду вид поверхности его глобулы - имеет ли она выступы, впадины и тп.
зацепление или узел - это свойство вложения многообразия, а топология у всех узлов - окружности
kjjff
объясните простым языком, плзв контексте, белки различной топологии (proteins of different topology)